云南大学校医院工会成立于1999年，受云南大学工会领导，现任工会主席胡兰芬由校医院全体工会会员民主选举产生。工会以党的路线、方针、政策、《中华人民共和国工会法》及《中国工会章程》为指导原则，切实维护校医院职工的合法权益、民主权利和精神文化需求。自工会成立以来，在学校党委、校工会及校医院等各级领导的关心和支持下，工会“围绕中心”服务大局，充分发挥工会的吸引力，凝聚力和影响力，突出参与和维权，为校医院的建设作出了积极贡献，工会开展的各项工作得到医院职工的充分支持和肯定，在职工中形成“有困难，找工会”的惯例。
工会主动帮助工作、生活上有困难的职工，把职工最关心、最直接、最现实的利益问题作为工会工作的落脚点和出发点，努力把每一个职工从精神和思想上团结起来，在平凡的岗位上充分发挥自己的所能，为医院的发展作贡献。工会还积极响应校工会的各项工作、活动安排，认真组织职工参加各项活动，如每年定期开展春游、秋游、青年节活动等。